El equipo Lagartos se fundó el 25 de octubre de 1994 emanado de la inquietud de un grupo de jóvenes de la Facultad de Derecho y Odontología de la Universidad Autónoma del Estado de México.

Desde entonces ha militado en las ligas amateur más importantes del Valle de Toluca en donde además se ha dedicado a labores sociales y altruistas.

En una época el equipo Lagartos acompañó a un equipo de Veteranos del Toluca a diversos municipios y entidades a dar juegos de exhibición, de ahí que constantemente busquemos un partido en otra entidad con la idea de fortalecer lazos con otras instituciones deportivas enarbolando las bondades del futbol para edificar una mejor sociedad.

Lagartos es una institución deportiva que a lo largo de su historia ha dado la oportunidad de practicar este deporte a más de 400 jugadores.

De esta forma, el equipo Lagartos FC se ha ganado un lugar en el futbol amateur del Estado de México donde actualmente continúa jugando y fomentado el deporte a través de la Liga Mexiquense de Futbol.